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- Title
Microsatellite-based genetic relationships in the genus Camellia: potential for improving cultivars.
- Authors
Caser, Matteo; Marinoni, Daniela Torello; Scariot, Valentina
- Abstract
There is a lack of published microsatellite data that characterizes Camellia spp. To address this, an initial study of sequence tagged microsatellite site (STMS) variation was undertaken with 132 accessions of Camellia spp., which included 24 accessions representing 22 different species or varieties as well as 63 cultivars of C. japonica, 33 cultivars of C. sasanqua, 7 cultivars of C. ×vernalis, 3 cultivars of C. ×hiemalis, and 2 cultivars of C. hybrida. The four primer sets used (MSCJAF37, MSCJAH46, MSCJAF25, and MSCJAH38) successfully amplified polymorphic alleles in all the species analysed, showing cross-transferability. Overall, 96 alleles were scored. MSCJAH38 primers produced the highest number of bands (30), while MSCJAH46 primers yielded the lowest number (15). The genetic distance between pairs of accessions was estimated on the basis of the Nei coefficient and a principal coordinate analysis was performed. The plot revealed a main differentiation between the C. japonica cultivars and the winter camellias. The distribution of the genetic variation, attributed by AMOVA, particularly highlighted genetic overlap among C. sasanqua cultivars and the cultivars belonging to C. ×vernalis, C. ×hiemalis, and C. hybrida. In conclusion, this study demonstrated that STMS markers offer a suitable method for detection of genetic variability and molecular study of camellia genotypes. Il y a peu d’informations publiées concernant les microsatellites chez les Camellia spp. Pour y remédier, une étude a été entreprise pour mesurer la variation à des locus microsatellites (STMS, « sequence tagged microsatellite site ») chez 132 accessions au sein du genre Camellia. Cette collection comptait 24 accessions représentaient 22 espèces différentes, 63 cultivars du C. japonica, 33 du C. sasanqua, 7 du C. ×vernalis, 3 du C. ×hiemalis et 2 du C. hybrida. Les quatre jeux d’amorces employés (MSCJAF37, MSCJAH46, MSCJAF25 et MSCJAH38) ont permis d’amplifier des allèles polymorphes chez toutes les espèces analysées, montrant ainsi leur transportabilité. Globalement, 96 allèles ont été observés. Les amorces pour le locus MSCJAH38 ont produit le plus grand nombre d’amplicons (30), tandis que celles pour le locus MSCJAH46 en ont produit le moins (15). La distance génétique entre paires d’accessions a été estimée à l’aide du coefficient de Nei et une analyse en coordonnées principales a été réalisée. Le graphique a révélé une différenciation majeure entre les cultivars du C. japonica et les Camellia d’hiver. La distribution de la variation génétique, examinée par AMOVA, a permis de mettre en lumière le chevauchement entre les cultivars du C. sasanqua et les cultivars du C. ×vernalis, C. ×hiemalis et C. hybrida. En conclusion, ce travail montre que les microsatellites sont un outil adéquat pour détecter la variabilité génétique et pour les études moléculaires chez les génotypes du genre Camellia.
- Subjects
MICROSATELLITE repeats; GENETIC polymorphisms; CAMELLIAS; PLANT genetics; CULTIVARS
- Publication
Genome, 2010, Vol 53, Issue 5, p384
- ISSN
0831-2796
- Publication type
Article
- DOI
10.1139/G10-012