Das Influenzavirus A ist eines der genetisch variabelsten Viren. Nicht jede Mutation ist für seine Virulenz von Bedeutung, aber einige Aminosäure-Mutationen führen zu einer erhöhten Pathogenität. Mutationen können u. a. die Bindung an die Wirtszellen beeinflussen, zu einer Suppression des angeborenen Immunsystems führen oder die Thermosensitivität der viralen Replikation ändern.