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- Title
Carbon utilization profiles of Fusarium virguliforme isolates.
- Authors
Tang, E.; Hill, C.B.; Hartman, G.L.
- Abstract
Fusarium virguliforme is the cause of sudden death syndrome in soybean. Physiological variability among isolates of the fungus is unknown. One way to measure physiologic variability is to analyze growth on different carbon sources. The carbon source utilization profiles of 18 F. virguliforme isolates were examined using the Biolog FF 96-well microplate, which contains 95 different carbon sources. The utilization of dextrin, <span class="smallcap">d</span>-mannitol, maltotriose, <span class="smallcap">d</span>-lactic acid methyl ester, N-acetyl-<span class="smallcap">d</span>-galactosamine, salicin, <span class="smallcap">d</span>-trehalose, and <span class="smallcap">l</span>-alanine differed significantly among isolates (P = 0.05). Carbon sources were grouped into 3 clusters based on their ability to promote growth of F. virguliforme, after calculating Euclidean distances among them. About 12% of the carbon sources promoted a high amount of mycelial growth, 39% promoted a medium amount of growth, and 49% promoted a low amount of mycelial growth; the latter was not significantly different from the water blank control. A hierarchical tree diagram was produced for the 18 isolates based on their carbon source utilization profiles using Ward's hierarchical analysis method. Two main clusters of isolates were formed. One cluster represented greater average mycelial growth on all of the carbon sources than the other cluster. In this study, variability in carbon source utilization among F. virguliforme isolates was evident, but the results were not associated with geographic origin of the isolates, year collected, or published data on aggressiveness. Additional research is needed to determine if these carbon utilization profiles are associated with other biological characteristics, like spore germination, propagule formation, and saprophytic competitiveness. Fusarium virguliforme est l'agent responsable du syndrome de la mort subite de la fève de soya. La variabilité physiologique des isolats de ce champignon est inconnue. Une façon d'en mesurer la variabilité physiologique consiste à en analyser la croissance sur différentes sources de carbone. Les profils d'utilisation de sources de carbone de 18 isolats de F. virguliforme ont été examinés à l'aide du système de microplaque Biolog FF à 96 puits, qui contient 95 sources différentes de carbone. L'utilisation de la dextrine, du <span class="smallcap">d</span>-mannitol, du maltotriose, du méthylester d'acide <span class="smallcap">d</span>-lactique, de la N-acétyl-<span class="smallcap">d</span>-galactosamine, de la salicine, du <span class="smallcap">d</span>-tréhalose et de la <span class="smallcap">l</span>-alanine différait significativement en fonction des isolats (P = 0,05). Les sources de carbone ont été groupées en 3 grappes selon leur capacité à promouvoir la croissance de F. virguliforme, après avoir calculé les distances Euclidiennes qui les séparent. Environ 12 % des sources de carbone permettaient la croissance d'une grande quantité de mycélium, 39 % permettaient la croissance d'une quantité moyenne et 49 % permettaient une croissance d'une faible quantité de mycélium, cette dernière n'étant pas significativement différente de l'eau utilisée comme contrôle. Un arbre hiérarchique a été produit pour les 18 isolats en fonction de leur profil d'utilisation de sources de carbone, à l'aide de la méthode de Ward. Deux grappes principales d'isolats ont été formées. Une grappe représentait les isolats dont la croissance moyenne de mycélium sur toutes les sources de carbone était plus élevée que l'autre. Dans cette étude, la variabilité d'utilisation des sources de carbone par les isolats de F. virguliforme était évidente, mais les résultats n'étaient pas associés à l'origine géographique des isolats, à l'année de récolte ou aux données publiées sur leur agressivité. Des recherches supplémentaires sont requises pour déterminer si ces profils d'utilisation du carbone sont associés à d'autres caractéristique biologiques comme la germination des spores, la formation de propagules ou la compétitivité saprophyte.
- Subjects
SOYBEAN diseases &; pests; CARBON compounds; FUNGAL diseases of plants; FUSARIUM; MICROPLATES; LACTIC acid; GALACTANS; DEXTRINS
- Publication
Canadian Journal of Microbiology, 2010, Vol 56, Issue 12, p979
- ISSN
0008-4166
- Publication type
Article
- DOI
10.1139/W10-085