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- Title
ESTANDARIZACIÓN DEL ANÁLISIS DE METILACIÓN CUANTITATIVA DE LOS PROMOTORES EN TOR1A Y THAP1 E IDENTIFICACIÓN DE LA VARIANTE D216H COMO CAUSA DE PENETRANCIA INCOMPLETA EN DISTONÍA GENÉTICA.
- Authors
Alitzel, Rodríguez-Gutiérrez; Beatriz, Sánchez-Hernández; Alberto, Ortega-Vázquez; Marisol, López-López; Nancy, Monroy-Jaramillo; Miguel Ángel, Ramírez-García
- Abstract
Objetivo: Estandarizar la metilación cuantitativa de las regiones promotoras de los genes TOR1A y THAP1 y la genotipificación de la variante común TOR1A_rs1801968 (p.D216H) en una muestra de pacientes con distonía genética por la variante TOR1A_ delGAG, portadores asintomáticos y controles sanos para analizar si son factores causales de la penetrancia incompleta en distonía genética. Antecedentes: La mayoría de casos de distonía generalizada de inicio temprano, asociada a DYT-TOR1A, se deben a la deleción del triplete GAG en el exón 5 del gen. Sin embargo, no todos los portadores de esta variante manifiestan la enfermedad, ya que presentan penetrancia incompleta (-30%). Se han postulado diversos factores causales incluyendo a la variante TOR1A_rs1801968 (p.D216H), donde el alelo D en cis se relaciona con distonía y el alelo H en trans, como un factor protector. Además, DYT-THAP1 regula la expresión de TOR1A; por lo que, algunos mecanismos epigenéticos en ambos promotores podrían ser factores adicionales. Número protocolo INNN_161/22 Métodos: Siguiendo todas las consideraciones éticas, se diseñaron 3 pares de oligonucleótidos y sondas específicas para amplificar y secuenciar las regiones promotoras de TOR1A y THAP1 con el programa PyroMark v2.0 (QIAGEN). El ADN extraído de muestras de sangre periférica, fue tratado con NaHSO3, se amplificó y secuenció por pirosecuenciación. La variante TOR1A_rs1801968 se genotipó por discriminación alélica en equipo QUANT Studio. El análisis estadístico incluyó la diferencia de medianas en los niveles de metilación y prueba exacta de Fisher para proporción de genotipos entre grupos. Resultados: En 12 pacientes vs. 16 controles pareados no se identificaron diferencias significativas entre el porcentaje de metilación de los promotores analizados mediante dos sondas, ni en la frecuencia de la variante. Queda pendiente el análisis de una segunda región en el promotor de TOR1A, la inclusión de información clínica e incrementar el tamaño de la muestra, incluyendo al grupo de portadores asintomáticos. Conclusiones: Se estandarizaron satisfactoriamente la metilación cuantitativa de los promotores TOR1A/THAP1 y el genotipado de la variante de riesgo, lo cual permitirá explorar su relación con la penetrancia en la distonía genética y ayudar a mejorar el asesoramiento genético para esta patología.
- Subjects
MEXICO; METHYLATION; CONFERENCES &; conventions; GENES; DYSTONIA; GENETIC mutation; PHENOTYPES
- Publication
Archivos de Neurociencias, 2024, Vol 29, p49
- ISSN
1028-5938
- Publication type
Article
- DOI
10.31157/an.v28iS1.514