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- Title
Détection et fonctions des modifications de l'ARN viral : perspectives en biologie et en médecine.
- Authors
Marchand, Virginie; Motorin, Yuri
- Abstract
Résumé: Les ARN viraux (soient dérivés de virus à ADN ou d'ARN génomique/ARN messagers de virus à ARN) produits et répliqués dans les cellules eucaryotes sont exposés à l'activité des machineries de modification de l'ARN de la cellule hôte. En outre, certains virus complexes codent leurs propres enzymes de modification de l'ARN, généralement des m7G et 2'-O-méthyltransférases liées à la coiffe, dont l'expression permet une modification spécifique des transcrits viraux et une modulation de la reconnaissance de l'ARN viral par les systèmes de restriction de l'hôte. Nous passerons ici en revue les connaissances actuelles en matière de détection des modifications de l'ARN viral par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS) et aux approches basées sur le séquençage à haut débit. La présence, l'origine et les fonctions caractérisées des modifications de l'ARN viral seront également abordées. Viral RNAs (either derived from DNA viruses and genomic/mRNAs of RNA viruses) produced and replicated in eukaryotic cells are exposed to the activity of host cell RNA modification machinery. Moreover, some complex viruses encode their own RNA modification enzymes, generally cap-related m7G-and 2'-O-methyltransferases whose expression allows specific modification of viral transcripts and modulation of viral RNA recognition by host restriction systems. Here we review current achievements in the detection of viral RNA modifications by liquid chromatography coupled to mass spectrometry (LC-MS) and deep sequencing-based approaches. The presence, origin and characterized functions of RNA modifications in viral RNAs are discussed.
- Subjects
RNA modification &; restriction; CATALYTIC RNA; EUKARYOTIC cells; LIQUID chromatography; MASS spectrometry; RNA viruses; DNA viruses; METHYLTRANSFERASES
- Publication
Virologie, 2021, Vol 25, Issue 2, p93
- ISSN
1267-8694
- Publication type
Article
- DOI
10.1684/vir.2021.0899