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- Title
AFLP analysis of genetic polymorphism and evolutionary relationships among cultivated and wild Nicotiana species.
- Authors
Ren, Nan; Timko, Michael P
- Abstract
Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis was used to determine the degree of intra- and inter-specific genetic variation in the genus Nicotiana. Forty-six lines of cultivated tobacco (Nicotiana tabacum L.) and seven wild Nicotiana species, including N. sylvestris, N. tomentosiformis, N. otophora, N. glutinosa, N. suaveolens, N. rustica, and N. longiflora, were analyzed, using at least eight different oligonucleotide primer combinations capable of detecting a minimum of 50 polymorphic bands per primer pair. The amount of genetic polymorphism present among cultivated tobacco lines (N. tabacum) was limited, as evidenced by the high degree of similarity in the AFLP profiles of cultivars collected worldwide. Six major clusters were found within cultivated tobacco that were primarily based upon geographic origin and manufacturing quality traits. A greater amount of genetic polymorphism exists among wild species of Nicotiana than among cultivated forms. Pairwise comparisons of the AFLP profiles of wild and cultivated Nicotiana species show that polymorphic bands present in N. tabacum can be found in at least one of three proposed wild progenitor species (i.e., N. sylvestris, N. tomentosiformis, and N. otophora). This observation provides additional support for these species contributing to the origin of N. tabacum.Key words: AFLP, evolution, genetic diversity, Nicotiana, tobacco, wild relatives of tobacco.L'analyse AFLP (polymorphisme de longueur des fragments amplifiés) a été employée afin de déterminer le niveau de variation génétique intra- et interspécifique au sein du genre Nicotiana. Quarante-six lignées du tabac cultivé (Nicotiana tabacum L.) et sept espèces sauvages du genre Nicotiana (N. sylvestris, N. tomentosiformis, N. otophora, N. glutinosa, N. suaveolenset N. longiflora) ont été analysées à l'aide d'au moins huit combinaisons différentes d'amorces oligonucléotidiques capables de détecter un minimum de 50 polymorphismes par paire d'amorces. La quantité de polymorphisme génétique présent au sein du tabac cultivé (N. tabacum) était limitée vu la grande similitude entre les profils AFLP des cultivars provenant de partout dans le monde. Six groupes majeurs ont été observés parmi les tabacs cultivés et ces regroupements reposaient principalement sur l'origine géographique ainsi qu'en fonction de certains caractères liés à la qualité manufacturière. Un plus grand polymorphisme génétique existe parmi les espèces sauvages que parmi les formes cultivées. Des comparaisons deux à deux des profils AFLP des espèces de Nicotiana sauvages et cultivées montrent que des bandes polymorphes présentes au sein du N. tabacum peuvent être trouvées également chez au moins une des trois espèces sauvages ancestrales proposées (N. sylvestris, N. tomentosiformis et N. otophora). Cette observation vient appuyer davantage l'hypothèse voulant que ces espèces aient été à l'origine du N. tabacum.Mots clés : AFLP, évolution, diversité génétique, Nicotiana, tabac, espèces sauvages apparentées au tabac.[Traduit par la Rédaction]
- Subjects
NICOTIANA; TOBACCO; PLANT species; GENETIC polymorphisms; POPULATION genetics
- Publication
Genome, 2001, Vol 44, Issue 4, p559
- ISSN
0831-2796
- Publication type
Article
- DOI
10.1139/g01-060