We found a match
Your institution may have access to this item. Find your institution then sign in to continue.
- Title
Genetic linkage map of Coffea canephora: effect of segregation distortion and analysis of recombination rate in male and female meioses.
- Authors
Lashermes, P; Combes, M C; Prakash, N S; Trouslot, P; Lorieux, M; Charrier, A
- Abstract
Two complementary segregating plant populations of Coffea canephora were produced from the same clone. One population (DH) comprised 92 doubled haploids derived from female gametes, while the other population (TC) was a test cross consisting of 44 individuals derived from male gametes. Based on the DH population, a genetic linkage map comprising 160 loci was constructed. Eleven linkage groups that putatively correspond to the 11 gametic chromosomes of C. canephora were identified. The mapped loci included more than 40 specific sequence-tagged site markers, either single-copy RFLP probes or microsatellites, that could serve as standard landmarks in coffee-genome analyses. Furthermore, comparisons for segregation distortion and recombination frequency between the two populations were performed. Although segregation distortions were observed in both populations, the frequency of loci exhibiting a very pronounced degree of distortion was especially high in the DH population. This observation is consistent with the hypothesis of strong zygotic selection among the DH population. The recombination frequencies in both populations were found to be almost indistinguishable. These results offer evidence in favour of the lack of significant sex differences in recombination in C. canephora.Key words: coffee, mapping, sex differences, segregation distortion, recombination frequency.Deux populations complémentaires de plantes en ségrégation ont été produites à partir d'un même clone de Coffea canephora. Une population (DH) comprend 92 haploïde-doublés dérivés des gamètes femelles, tandis que l'autre (TC) consiste en 44 individus issus des gamètes mâles. Sur la base de la population DH, une carte génétique de liaison, comprenant 160 loci, a été construite. Onze groupes de liaison correspondant très vraisemblablement aux 11 chromosomes de C. canephora ont été identifiés. Parmi les loci cartographiés sont inclus 40 marqueurs « séquence-spécifiques », constitués par des sondes associées à du polymorphisme de fragments de restriction ou par des microsatellites, qui pourraient servir de balises de référence dans les études portant sur le génome des caféiers. Par ailleurs, une comparaison, entre les deux populations, des distorsions de ségrégation et des fréquences de recombinaison a été réalisée. Bien que des distorsions de ségrégation aient été observées au sein des deux populations, la fréquence des loci montrant un fort degré de distorsion est particulièrement élevée chez la population DH. Cette observation est cohérente avec l'hypothèse d'une forte sélection zygotique au sein de la population DH. Les fréquences de recombinaison apparaissent globalement similaires au sein des deux populations. Ces résultats suggèrent l'absence de différences sexuelles significatives pour la recombinaison chez C. canephora.Mots clés : caféier, cartographie, différences sexuelles, distorsion de ségrégation, fréquence de recombinaison.
- Subjects
PLANT populations; COFFEE; HAPLOIDY; GENE mapping; GENETIC recombination
- Publication
Genome, 2001, Vol 44, Issue 4, p589
- ISSN
0831-2796
- Publication type
Article
- DOI
10.1139/g01-041